Tras la caída de las bombas sobre Hiroshima y Nagasaki, y una vez disipado el polvo de la Segunda Guerra Mundial, las naciones del mundo reconstruyeron sus economías e infraestructuras, y comenzó la era atómica. Las naciones forjaron alianzas mediante una sólida diplomacia. Construyeron cohetes y satélites e iniciaron la carrera espacial. Fabricaron suficientes misiles nucleares como para destruir el mundo muchas veces. Sus espías estaban a la vuelta de cada esquina. La Guerra Fría había comenzado.

The Manhattan Project: Energy Empire – Cold War añade nuevos niveles de estrategia y opciones a The Manhattan Project: Energy Empire. Los diversos componentes de esta expansión se dividen en módulos independientes. Los jugadores pueden seleccionar los módulos que más les gusten para personalizar su partida, o incluso optar por añadir finalmente todos los módulos a su juego. Se recomienda incorporar estos módulos a Energy Empire de forma gradual y no todos a la vez.

La expansión Cold War añade muchas más oportunidades de interacción entre jugadores y crea formas de ganar mucho más variadas. También incluye un modo solitario de Clash of Netions.