Space Empires: Replicators, la segunda expansión de la serie Space Empires, añade una serie de características al juego base, empezando por los Replicators. Las máquinas de Von-Neumann ("Replicators") son máquinas autorreplicantes que se comportan, investigan y reproducen de forma diferente a otros imperios, al tiempo que cuentan con sus propias Empire Advantages. Los Replicators pueden ser utilizados por un quinto jugador, como oponente en partidas cooperativas o como un imperio de aprendizaje para nuevos jugadores, ya que el jugador Replicator no tiene que rellenar una hoja de producción ni llevar un registro de la tecnología de sus naves.

Space Empires: Replicators también incluye losetas de terreno de tamaño hexagonal para planetas, asteroides, nebulosas y otros efectos de terreno permanentes. Cuando un marcador de exploración revela un efecto de terreno que permanece en el mapa, el marcador de exploración se retira y se sustituye por una loseta, lo que proporciona al mapa un agradable efecto visual. (Al retirar el marcador de exploración, también se crea más espacio en los hexágonos porque ahora todo el hexágono es el terreno). Para partidas épicas, el reverso de algunas de estas losetas puede utilizarse para conectar dos tableros de Space Empires.

En esta expansión se incluye nuevo terreno de Deep Space, con la Galactic Capital (que viene con su propio escenario), Regional Map, Gravitational Anomaly, Space Pirates y el Fold in Space.

A cada jugador también se le reparte su propio mazo de recursos (aleatorio) al principio de la partida. Todos empiezan con una mano de tres cartas y roban una nueva en cada turno. Estas cartas pueden usarse como un evento o canjearse por CP. Las cartas influyen en las batallas, la exploración, la economía; en casi todos los aspectos del juego; pueden añadir giros impredecibles e influir en tu estrategia. Las cartas de recursos más poderosas requieren que descartes una carta adicional para poder jugarlas.

Se incluyen nuevas naves en Space Empires: Replicators, y estas naves requieren que se investigue una nueva tecnología: Advanced Construction. Hay tres niveles de Advanced Construction, y no se puede investigar hasta la Economic Phase posterior a que tu imperio haya construido un BC o una nave más grande. Por lo tanto, no estarán disponibles hasta la mitad de la partida como muy pronto. Las naves que desbloquea Advanced Construction incluyen:

Battle Carriers (BV), que son grandes portanaves que pueden luchar bien, transportar seis Fighters y vienen equipados con Anti-Sensor Hull (inmunes a las Mines). También se pueden investigar y construir Fighter 4.

Advanced Destroyers (DDX) que pueden montar Attack 2, Defense 2, y vienen con Heavy Warheads (impactan automáticamente con un 1 o un 2).

Advanced Raiders (RX) que pueden montar Attack 3, Defense 3, ¡y pueden transportar una unidad terrestre!

Todas las naves avanzadas también pueden equiparse con la tecnología Fast (similar a los BC) si se investiga Fast 2. Estos cambios no afectan al principio ni a la mitad de la partida, pero hacen que los DD y los R sigan siendo relevantes en la fase final. Los Raiders y los Fighters suelen ser factores sorpresa que, una vez que el oponente ha reaccionado a ellos, pierden su eficacia. Esto da a los jugadores otra oportunidad de dar un giro inesperado más adelante en la partida.

Se han incluido algunas fichas adicionales para todos los jugadores. También se han corregido las fichas de Fleet y Miner que se imprimieron de forma errónea en la expansión Close Encounters. Se han añadido Empire Advantages adicionales.