Star Trek: Five-Year Mission es un juego cooperativo de colocación de dados para 3-7 jugadores que asumen los papeles de miembros de la tripulación, ya sea del USS Enterprise (de la serie original Star Trek) o del USS Enterprise-D (de Star Trek: The Next Generation). Cada miembro de la tripulación tiene una habilidad diferente y las habilidades de la tripulación varían en cada nave.

En estos roles, los jugadores intentan resolver cooperativamente una serie de alertas azules (fáciles), amarillas (medias) y rojas (difíciles) para ganar puntos, intentando superar uno de los 6 niveles de dificultad diferentes para ganar antes de fallar cinco de estas alertas o de que el Enterprise sea destruido. Los jugadores deben lidiar con heridas que bloquean los dados fuera del juego, daños en la nave que pueden obligar a los jugadores a intentar alertas más difíciles, eventos urgentes que deben completarse en 3 minutos, la directriz suprema, así como alertas amarillas y rojas que obligan a poner en juego cartas de alerta adicionales, acercándote cada vez más al fracaso.