En Inca Empire, cada jugador es un "Apu", o líder de una de las cuatro regiones ("suyus"). Tu labor como Apu es aumentar tu estatus ante los ojos del emperador divino ("Sapa Inca") haciendo el mejor trabajo posible al expandir y mejorar el imperio. Cada Apu comienza con la mano de obra de su región. Construyen caminos y conquistan regiones vecinas, aumentando la mano de obra y los recursos disponibles para ellos. Los Apus son recompensados por cada nueva región que añaden al imperio y por mejoras como terrazas, guarniciones, ciudades y templos.

El jugador que tenga más puntos de victoria (PV) en el momento en que Pizarro llegue a Cuzco, la capital inca, gana la partida.

Nota: Debido a la naturaleza altamente interactiva de la colocación de las cartas de Sol, Inca Empire no se puede jugar con solo dos jugadores.

Inca Empire es una reimplementación de Tahuantinsuyu.