En Evolution: The Origin of Species, los jugadores hacen el trabajo de la naturaleza, poniendo animales en juego y haciéndolos evolucionar rasgo por rasgo para ayudarles a sobrevivir y prosperar. Cada jugador comienza con una mano de seis cartas que muestran un animal en el reverso y uno o dos rasgos en el anverso.

Cada ronda consta de cuatro fases. Durante el Desarrollo, los jugadores se turnan para jugar una carta de su mano, ya sea como un animal (boca abajo) o como un rasgo en uno de sus animales existentes (boca arriba y colocada debajo del animal). Los rasgos incluyen Carnivorous, Camouflage, Sharp Vision, Swimming, Poisonous y Communication; si una carta tiene dos rasgos, el jugador elige qué rasgo adquiere el animal, ocultando el otro rasgo debajo de él. Una vez que un jugador pasa durante esta fase, ya no puede jugar más cartas.

Durante la Determinación del Banco de Alimentos, un jugador lanza 1-2 dados (posiblemente sumando dos al total) para determinar la cantidad de comida disponible para la ronda.

Durante la Alimentación, los jugadores se turnan para adquirir un cubo de comida y «alimentar» a uno de sus animales. Algunos rasgos otorgan a los animales habilidades especiales que se pueden usar durante la Alimentación o en otros momentos de la partida. Los animales también pueden ser carnívoros, lo que les permite atacar a otro animal para alimentarse, aunque ese animal podría tener una defensa como High Body Weight o Tail Loss que le permita sobrevivir. Un animal no puede tomar más comida de la que necesita a menos que tenga tejido adiposo, lo que le permite almacenar comida para futuras rondas.

Durante la Extinción y Robo, cualquier animal que no esté completamente alimentado muere; el propietario toma ese animal y todos sus rasgos y los apila en su pila de descarte personal. Luego, cada jugador recibe nuevas cartas en su mano equivalentes a una más el número de animales vivos que tenga ese jugador.

Cuando se agota el mazo, los jugadores juegan una ronda final y luego cuentan los puntos. Cada animal vivo vale 2 PV, y cada rasgo en un animal vivo vale 1 PV; algunos rasgos (Carnivorous y Parasite) otorgan PV adicionales, pero hacen que sea más difícil mantener vivo a un animal. El jugador con más PV gana.

Al combinar dos copias de Evolution, pueden jugar hasta ocho jugadores en una partida.